《牡丹江师范学院学报（哲学社会科学版）》（双月刊）创刊于1979年，是由牡丹江师范学院主办的学术刊物。本刊办刊宗旨：坚持社会主义办刊方向，贯彻党的“百花齐放，百空争鸣”方针，开展学术讨论，交流教学和科研成果，发现和扶植人才，培养学术理论队伍，为提高牡丹江师范学院教学质量和科研水平服务，为发展和繁荣我国社会科学学术研究事业服务。

《牡丹江师范学院学报》（自然科学版）（季刊）创刊于1975年，是由黑龙江省教育厅主管、牡丹江师范学院主办、国内外公开发行的综合性学术期刊（季刊）。主要栏目：数学、物理、化学、生命科学、黑龙江省农林研究、地理科学、计算机理论及应用、体育理论研究、教育理论研究等栏目。本刊坚持社会主义办刊方向，贯彻党的“百花齐放，百家争鸣”方针，坚持严谨科学，求实创新，大胆探索的办刊方针，鼓励理论和经验研究相结合的学术取向，提倡学术批评和交锋。我们希望，通过各界人士的共同努力，《牡丹江师范学院学报》能够发表一系列具有开创性的研究成果，繁荣学术，促进交流。本刊于2006年先后加入“中国学术期刊（光盘版）”、“中国期刊网”全文数据库、“万方—数字化刊群”和“中文科技期刊数据库”，在学术界的影响不断扩大，并获首届全国优秀社科学报整体设计奖。