《南京审计学院学报》坚持为社会主义服务的方向，坚持以马克思列宁主义、毛泽东思想和邓小平理论为指导，贯彻“百花齐放、百家争鸣”和“古为今用、洋为中用”的方针，坚持实事求是、理论与实际相结合的严谨学风，传播先进的科学文化知识，弘扬民族优秀科学文化，促进国际科学文化交流，探索高等教育、教学及管理诸方面的规律，活跃教学与科研的学术风气，为教学与科研服务。

《南京审计学院学报》坚持正确的舆论导向，反映国内外经济、管理、法学等学科和高等教育研究的前沿动态，为我国的改革开放和教育事业的繁荣服务。选用稿件突出理论与实践的结合的原则。